Glossaire du blob — 47 termes scientifiques expliqués

Glossaire du blob — 47 termes scientifiques expliqués

Le vocabulaire du blob (Physarum polycephalum) emprunte à la biologie cellulaire, à la mycologie historique et à l'éthologie. Voici les termes essentiels — classés alphabétiquement.

A

Agar

Polysaccharide extrait d'algues rouges, utilisé comme support de culture. ⚠️ Il ne nourrit pas le blob : c'est un gel où il se déplace et reste humide. La nourriture, ce sont les flocons d'avoine. On le dose à 2 g pour 100 mL d'eau (2 %). Notre recharge de 10 g permet donc de préparer 500 mL de gélose : compte environ 32 mL par boîte de Petri de 90 mm coulée sur 5 mm, soit une quinzaine de boîtes.

Amibe

Cellule eucaryote sans paroi rigide, qui se déplace par pseudopodes. Le blob est une amibe géante.

Amoebozoaires (Amoebozoa)

Le grand groupe d'eucaryotes auquel appartient le blob. Ce n'est pas un « règne » : c'est un supergroupe, à distance évolutive comparable des animaux et des champignons. Les horloges moléculaires font remonter cette lignée à plus d'un milliard d'années. Attention : dire « les Amoebozoa ne sont jamais pathogènes » est faux (voir Entamoeba histolytica) — c'est Physarum polycephalum en particulier qui ne l'est pas.

ATP

Adénosine triphosphate, molécule énergétique universelle. Le blob en synthétise par phosphorylation oxydative.

B

Biofilm

Communauté microbienne sur une surface. Les bactéries qui la composent font partie du menu du blob.

Blob

Nom vernaculaire français du Physarum polycephalum. Popularisé en 2019 lors de l'exposition au Parc Zoologique de Paris.

C

Chitine

Polysaccharide constituant la paroi des champignons. Le blob n'en a pas.

Cytoplasme

Contenu intracellulaire. Chez le blob, il circule dans les deux sens dans le réseau veineux (cyclose en va-et-vient), en inversant son sens toutes les 1 à 2 minutes.

Cycle de vie

Sclérote → plasmodium → sporulation → spores → amibes → fusion de gamètes → nouveau plasmodium. Article détaillé.

D

De Bary, Anton

Botaniste allemand (1831-1888) qui, en 1859, a séparé les myxomycètes des champignons en les rapprochant des organismes de type animal (ses « Mycetozoa »). La monographie remaniée paraît en 1864.

Diploïde

État cellulaire avec deux jeux de chromosomes. Le plasmodium est diploïde.

Dormance

État de vie ralentie. Le sclérote est la forme dormante.

E

Élève ton blob

Projet pédagogique CNES + CNRS lancé en 2021 lors de la mission Alpha de Thomas Pesquet. Environ 4 500 établissements candidats, dont ~2 000 sélectionnés. Ce n'était pas une expérience scientifique : 4 échantillons en orbite, aucune réplication, aucune publication à comité de lecture — le but était de faire manipuler des élèves, et c'est très bien comme ça.

F

Fusion

Deux plasmodiums compatibles peuvent fusionner en un seul individu. ⚠️ Ce n'est pas de la reproduction : la reproduction sexuée, elle, se joue à l'étape des amibes haploïdes qui fusionnent en zygote.

G

Gradient chimique

Variation progressive d'une concentration chimique. Le blob détecte sa nourriture par chimiotaxie.

H

Haploïde

État cellulaire avec un seul jeu de chromosomes. Les amibes sont haploïdes.

Hétérotrophe

Organisme qui consomme la matière organique d'autres êtres vivants. Le blob est hétérotrophe.

L

Labyrinthe

Expérience référence de Nakagaki (2000, Nature). Le dispositif est inclus dans le Kit Blob Lab.

M

Major Tom

Notre souche héroïne : le Physarum polycephalum LU352, la souche exacte envoyée sur l'ISS par le CNES en 2021 (confirmé par le CNES).

Mémoire externe

Capacité du blob à s'orienter grâce aux traces de mucus qu'il laisse derrière lui, et qu'il évite ensuite (Smith-Ferguson et coll., 2017). La « mémoire » est donc dans l'environnement, pas dans la cellule.

Microgravité

État de gravité quasi-nulle (ISS). Des blobs y ont été observés en 2021 dans le cadre d'« Élève ton blob ».

Mycelium

Réseau de filaments des champignons. Le blob n'a pas de mycelium (cf. Blob vs champignon).

Myxogastria

Le nom accepté aujourd'hui pour le groupe du blob. « Myxomycetes » en est le synonyme traditionnel. Chaîne complète : Eukaryota › Amoebozoa › Evosea › Eumycetozoa › Myxogastria › Physarales › Physaraceae › Physarum polycephalum.

Myxomycète

Nom historique du groupe, du grec myxa (mucus) + mykês (champignon) — une étymologie trompeuse, puisque ce n'est pas un champignon. Aujourd'hui on dit plutôt Myxogastria.

N

Nakagaki, Toshiyuki

Biologiste japonais (Hokkaido). Auteur des expériences labyrinthe (2000) et du réseau de Tokyo (2010).

Noyau

Organite contenant l'ADN. Le plasmodium contient des millions de noyaux dans une seule cellule.

O

Optimisation de réseau

Capacité du blob à relier des sources de nourriture par un réseau au bon compromis entre longueur totale et robustesse (Tero et coll., 2010, Science).

P

Pesquet, Thomas

Astronaute français. ⚠️ Il n'a pas emporté les blobs : il a décollé le 23 avril 2021 sans eux. Les 4 sclérotes sont arrivés à bord par le cargo Cygnus le 12 août 2021, et il les a réveillés le 2 septembre 2021. Article complet.

Petri (boîte de)

Récipient stérile pour la culture du blob. Nos kits utilisent quatre formats selon l'usage : 60 mm (réveil et repiquages), 90 mm (croissance et expériences courantes), 120 mm rondes (le labyrinthe) et 120 mm carrées (le réseau de Tokyo).

Phagocytose

Mode de nutrition du blob : il englobe physiquement sa nourriture.

Physarum polycephalum

Nom scientifique du blob. Du grec : physarum (vésicule) + polycephalum (plusieurs têtes). Décrit par Schweinitz en 1822.

Plasmodium

Forme active du blob : cellule géante jaune vif, mobile.

R

Rangs (classification)

Les rangs linnéens classiques (règne, embranchement, classe…) ne s'appliquent plus vraiment aux eucaryotes : la classification de référence (Adl et coll., 2019) les a abandonnés au profit d'une hiérarchie de groupes emboîtés. C'est pour ça qu'on ne parle pas de « règne Amoebozoa », mais de supergroupe.

Reid, Chris

Biologiste australien, spécialiste du comportement du Physarum. Co-auteur de Smith-Ferguson et coll. (2017), l'étude de référence sur la mémoire spatiale externalisée : le blob s'oriente grâce aux traces de mucus qu'il laisse derrière lui, et qu'il évite ensuite.

S

Saprophyte

Mode de nutrition des champignons, par absorption. Le blob n'est PAS saprophyte : il phagocyte.

Sclérote

Forme dormante du blob : croûte sèche jaune. Conservée au sec et à l'abri de la lumière, elle reste viable au moins un an, souvent bien plus. C'est ce que tu reçois dans ton kit BlobFarm.

Sclérotisation

Processus de passage du plasmodium actif à la forme dormante.

Slime mold

Terme anglais pour myxomycète. Littéralement « moisissure visqueuse ». Inadapté : ce n'est pas une moisissure.

Spore

Cellule reproductive produite lors de la sporulation.

Sporulation

Formation des sporocystes et production de spores (avec méiose), qui libéreront des amibes haploïdes.

Stentor

Genre de protozoaire cilié unicellulaire. Souvent comparé au blob en éthologie cellulaire.

T

Tokyo Subway

Expérience référence de Tero, Nakagaki et coll. (2010, Science). Le dispositif est inclus dans le Kit Blob Lab.

Type sexuel

Catégorie de compatibilité reproductive. Chez Physarum polycephalum, la compatibilité repose sur trois locus : matA (16 allèles) × matB (15) × matC (3) = 720 combinaisons possibles (Kawano, Kuroiwa & Anderson, 1987, Journal of General Microbiology, 133(9), 2539-2546). ⚠️ Ce n'est pas un record du vivant : le champignon Schizophyllum commune en compterait plus de 23 000.

U

Unicellulaire

Constitué d'une seule cellule. Le blob reste unicellulaire alors qu'il peut couvrir, en culture, une surface visible à l'œil nu bien plus grande qu'une boîte de Petri.

V

Veine plasmodique

Canal cytoplasmique du plasmodium. Le réseau veineux est l'aspect le plus photogénique du blob.

Vitesse de croissance

Le front du blob avance de quelques millimètres à quelques centimètres par heure, d'autant plus vite qu'il a faim. Ça dépend de la température, de la souche et de l'état du substrat — méfie-toi des chiffres uniques annoncés partout.

Z

Zygote

Cellule diploïde issue de la fusion de deux gamètes haploïdes. Point de départ d'un nouveau plasmodium.


Glossaire rédigé par l'équipe BlobFarm. Voir aussi nos sources scientifiques complètes.